Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NTF4P34130 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTF4P34130 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTF4P34130 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTF4P34130 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTF4P34130 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NTF4P34130 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NTF4P34130 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms