Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GTF2E1P29083 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GTF2E1P29083 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms