Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PDE4AP27815 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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