Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ITGA6P23229 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA6P23229 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms