Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CDK11BP21127 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms