Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
KRT10P13645 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT10P13645 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
KRT10P13645 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms