Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGA4P13612 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ITGA4P13612 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms