Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
IFITM1P13164 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
IFITM1P13164 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms