Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
U2AF1L5P0DN76 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
U2AF1L5P0DN76 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms