Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGA3P0DJD8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGA3P0DJD8 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms