Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
C4BP0C0L5 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C4BP0C0L5 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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