Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APOA1P02647 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APOA1P02647 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APOA1P02647 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms