Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
HLA-DQB1P01920 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
HLA-DQB1P01920 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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