Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC9O60706 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC9O60706 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms