Protein–RNA interactions for Protein: O15042

U2SURP, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2SURPO15042 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
U2SURPO15042 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
U2SURPO15042 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms