Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ERVW-1Q9UQF0 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ERVW-1Q9UQF0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms