Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF8Q9UPP1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms