Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW8

ZNF180, Zinc finger protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF180Q9UJW8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF180Q9UJW8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms