Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SFMBT1Q9UHJ3 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SFMBT1Q9UHJ3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms