Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.738e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 H2AFY-211ENST00000507868 861 ntTSL 225.88■■□□□ 1.738e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARL6IP4-219ENST00000542099 1119 ntTSL 325.87■■□□□ 1.732e-7■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 MORF4L1-204ENST00000557961 591 ntTSL 225.73■■□□□ 1.718e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 FRMD8-205ENST00000526201 568 ntTSL 524.76■■□□□ 1.558e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.518e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PYCR3-204ENST00000447926 1324 ntTSL 224.35■■□□□ 1.498e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PYCR3-206ENST00000482616 830 ntTSL 224.25■■□□□ 1.478e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 KIAA0100-215ENST00000583403 1271 ntTSL 1 (best)24.12■■□□□ 1.458e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.442e-7■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARL6IP4-216ENST00000539770 1295 ntTSL 1 (best)23.99■■□□□ 1.432e-7■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 FRMD8-206ENST00000528854 572 ntTSL 223.76■■□□□ 1.398e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.388e-20■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.368e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.358e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.342e-7■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.338e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PPP4R1-228ENST00000584074 625 ntTSL 323.29■■□□□ 1.325e-13■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 SNTB2-203ENST00000467311 1489 ntTSL 1 (best)23.15■■□□□ 1.38e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.258e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.22e-7■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.158e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.148e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PPP4R1-221ENST00000582240 578 ntTSL 422.04■■□□□ 1.125e-13■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.072e-7■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-202ENST00000577428 555 ntTSL 421.52■■□□□ 1.048e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.028e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 FBXO17-203ENST00000596025 935 ntTSL 221.39■■□□□ 1.018e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.018e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ATF1-202ENST00000549612 568 ntTSL 521.32■■□□□ 18e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 18e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 TMEM249-202ENST00000562477 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)20.79■□□□□ 0.928e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 HOMER3-209ENST00000596482 866 ntTSL 520.67■□□□□ 0.98e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF17-202ENST00000536170 793 ntTSL 220.64■□□□□ 0.898e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.882e-7■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 LPP-204ENST00000420410 535 ntTSL 320.51■□□□□ 0.878e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.878e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 KLHL18-202ENST00000433449 560 ntTSL 420.32■□□□□ 0.848e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.848e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.848e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.838e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 MORF4L1-220ENST00000559930 678 ntTSL 420.18■□□□□ 0.828e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.828e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.828e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PPP4R1-215ENST00000580182 582 ntTSL 320.01■□□□□ 0.795e-13■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 SNX4-203ENST00000471751 1308 ntTSL 219.76■□□□□ 0.758e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.738e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 SNX4-204ENST00000473417 754 ntTSL 319.59■□□□□ 0.738e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 KLHL18-203ENST00000437353 463 ntTSL 219.49■□□□□ 0.718e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 BTF3-207ENST00000512257 887 ntTSL 1 (best)19.41■□□□□ 0.78e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.698e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 HOMER3-210ENST00000599097 770 ntTSL 319.31■□□□□ 0.688e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 H2AFY-210ENST00000506671 1905 ntTSL 519.31■□□□□ 0.688e-20■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 KIAA0100-205ENST00000577417 1839 ntTSL 1 (best)19■□□□□ 0.638e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.628e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-223ENST00000583689 563 ntTSL 218.83■□□□□ 0.68e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-228ENST00000584409 545 ntTSL 318.8■□□□□ 0.68e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-221ENST00000582993 565 ntTSL 218.8■□□□□ 0.68e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-225ENST00000583834 1993 ntTSL 318.74■□□□□ 0.598e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.578e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.578e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 KLHL18-206ENST00000483201 375 ntTSL 1 (best)18.53■□□□□ 0.568e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF7-210ENST00000449979 682 ntTSL 518.38■□□□□ 0.538e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.518e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 IFFO1-209ENST00000487279 2786 ntTSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.498e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 BTF3-206ENST00000510787 610 ntTSL 217.97■□□□□ 0.478e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.438e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ZC3H7A-208ENST00000572781 564 ntTSL 417.53■□□□□ 0.48e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.368e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.332e-7■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 H2AFY-213ENST00000508785 966 ntTSL 216.97■□□□□ 0.318e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PPARGC1B-206ENST00000461780 566 ntTSL 416.93■□□□□ 0.38e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 BSG-205ENST00000571735 2155 ntTSL 216.88■□□□□ 0.298e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.288e-20■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 SNTB2-202ENST00000360496 415 ntTSL 216.63■□□□□ 0.258e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ZC3H7A-213ENST00000575170 831 ntTSL 316.59■□□□□ 0.258e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-218ENST00000582359 694 ntTSL 316.58■□□□□ 0.248e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ZC3H7A-216ENST00000576018 575 ntTSL 416.44■□□□□ 0.228e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 SNTB2-204ENST00000524887 537 ntTSL 316.41■□□□□ 0.228e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 SNTB2-205ENST00000525632 536 ntTSL 316.41■□□□□ 0.228e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ZC3H7A-205ENST00000571198 2343 ntTSL 216.4■□□□□ 0.228e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-205ENST00000578862 549 ntTSL 416.12■□□□□ 0.178e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.178e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PPP4R1-206ENST00000577779 481 ntTSL 216.01■□□□□ 0.155e-13■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 IFFO1-210ENST00000488007 3001 ntTSL 515.79■□□□□ 0.128e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.128e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-229ENST00000585240 554 ntTSL 415.77■□□□□ 0.128e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 FBXO17-207ENST00000601394 2366 ntTSL 515.74■□□□□ 0.118e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 CEMIP-205ENST00000559966 488 ntTSL 215.73■□□□□ 0.118e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.118e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-208ENST00000579837 418 ntTSL 315.7■□□□□ 0.18e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-216ENST00000582118 560 ntTSL 415.7■□□□□ 0.18e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 HOMER3-212ENST00000600077 675 ntTSL 315.64■□□□□ 0.098e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 KIAA0100-210ENST00000580882 1582 ntTSL 1 (best)15.58■□□□□ 0.088e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.078e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.068e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.038e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.018e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 NAT9-227ENST00000584022 1103 ntTSL 215.14■□□□□ 0.018e-6■■□□□ 11.6
FAM120AQ9NZB2 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 08e-6■■□□□ 11.6
Retrieved 100 of 20,049 protein–RNA pairs in 614.4 ms