Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RHBDL2Q9NX52 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms