Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
BHLHE41Q9C0J9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms