Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ROPN1BQ9BZX4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ROPN1BQ9BZX4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms