Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXM0

PRX, Periaxin, humanhuman

Predictions only

Length 1,461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRXQ9BXM0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRXQ9BXM0 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRXQ9BXM0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms