Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNDC11Q9BVV2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNDC11Q9BVV2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms