Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC39A3Q9BRY0 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms