Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ65

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USB1Q9BQ65 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
USB1Q9BQ65 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms