Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PITX2Q99697 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PITX2Q99697 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms