Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SNX18Q96RF0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SNX18Q96RF0 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms