Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCDC7Q96M83 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms