Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM47Q96LD4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM47Q96LD4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms