Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 LGALS8-219ENST00000526589 6420 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.617e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP4-208ENST00000429422 3724 ntTSL 1 (best)11.22□□□□□ -0.617e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-207ENST00000398224 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-210ENST00000398229 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-230ENST00000639888 4299 ntTSL 511.15□□□□□ -0.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRIM5-207ENST00000438025 767 ntTSL 311.15□□□□□ -0.627e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAF1C-209ENST00000564208 3810 ntTSL 211.14□□□□□ -0.637e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CKMT2-AS1-204ENST00000503483 572 ntTSL 311.14□□□□□ -0.637e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEIL1-201ENST00000355059 3759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.637e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HAUS8-203ENST00000593360 3176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.637e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-210ENST00000547955 609 ntTSL 511.1□□□□□ -0.637e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EXOC7-221ENST00000634349 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.637e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WDR26-207ENST00000480676 1725 ntTSL 511.08□□□□□ -0.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MARCH6-208ENST00000510792 1963 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC016026.1-201ENST00000476405 4328 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPATS2L-210ENST00000421573 600 ntTSL 511.05□□□□□ -0.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 HIF1AN-205ENST00000533589 1042 ntTSL 311.05□□□□□ -0.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AP002360.1-206ENST00000534586 711 ntTSL 311.03□□□□□ -0.647e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEX19-202ENST00000392220 796 ntTSL 511.02□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEX19-209ENST00000532516 552 ntTSL 211.02□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEX19-210ENST00000532643 894 ntTSL 211.02□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DDRGK1-203ENST00000470203 480 ntTSL 311.01□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-223ENST00000552985 762 ntTSL 311□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDXK-213ENST00000472777 460 ntTSL 510.99□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WEE1-201ENST00000299613 3436 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZSCAN9-205ENST00000527844 1182 ntTSL 510.98□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZNF589-201ENST00000354698 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.657e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ILF3-222ENST00000592763 3866 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.667e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KIF5A-201ENST00000286452 3527 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.667e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCBP2-212ENST00000479647 552 ntTSL 310.93□□□□□ -0.667e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PEX19-206ENST00000495624 734 ntTSL 310.93□□□□□ -0.667e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AP5M1-202ENST00000431972 1815 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.667e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LRRFIP1-211ENST00000478958 2869 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NEIL1-202ENST00000561643 3271 ntTSL 510.87□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EXOC7-202ENST00000335146 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSL1-206ENST00000626725 790 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TRIM5-209ENST00000483835 918 ntTSL 510.87□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TPCN1-202ENST00000392569 2558 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TARDBP-206ENST00000473869 1946 ntTSL 510.84□□□□□ -0.677e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSL1-202ENST00000366977 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.687e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 EXOC7-219ENST00000592559 645 ntTSL 510.81□□□□□ -0.687e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 MVK-209ENST00000540353 4109 ntTSL 210.76□□□□□ -0.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PRDM15-212ENST00000486812 7072 ntTSL 1 (best)10.76□□□□□ -0.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SUN1-212ENST00000429178 3701 ntTSL 1 (best)10.75□□□□□ -0.697e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 EFL1-202ENST00000359445 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.697e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ZNF589-207ENST00000457782 3658 ntTSL 210.71□□□□□ -0.697e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 ILF3-208ENST00000587928 4230 ntTSL 210.7□□□□□ -0.77e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NCMAP-201ENST00000374392 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.77e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NUBPL-202ENST00000418681 1804 ntTSL 210.65□□□□□ -0.717e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LGALS8-212ENST00000450372 6281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.717e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 MTOR-201ENST00000361445 8677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.727e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.727e-6■■■■■ 27.5
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TBRG4Q969Z0 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)10.46□□□□□ -0.737e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 KLC1-220ENST00000555856 535 ntTSL 310.46□□□□□ -0.737e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PPP4R1-203ENST00000400556 3925 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-218ENST00000639007 4277 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.41□□□□□ -0.747e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)10.38□□□□□ -0.757e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NSMCE2-201ENST00000287437 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.757e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBP4-204ENST00000629763 838 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.757e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 WDR26-205ENST00000479727 795 ntTSL 310.33□□□□□ -0.767e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.767e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 RBM7-209ENST00000624815 3587 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.767e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AFDN-204ENST00000366809 4839 ntTSL 1 (best)10.29□□□□□ -0.767e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 AC073869.1-202ENST00000438378 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.777e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 CDC42SE1-207ENST00000540998 3181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.777e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.777e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.787e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TMEM106A-203ENST00000586685 571 ntTSL 410.16□□□□□ -0.787e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 EEF2-203ENST00000596417 218 ntTSL 210.13□□□□□ -0.797e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TSPAN7-201ENST00000286824 1270 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.797e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 PDE9A-204ENST00000335512 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.797e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.87e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SUN1-202ENST00000389574 3812 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.87e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SLC35E1-205ENST00000470077 552 ntTSL 410.05□□□□□ -0.87e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.817e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LGALS8-213ENST00000454943 846 ntTSL 510□□□□□ -0.817e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 MTHFD1-213ENST00000556284 932 ntTSL 59.99□□□□□ -0.817e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NRIP1-206ENST00000637963 498 ntTSL 49.98□□□□□ -0.817e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 NOP2-218ENST00000545200 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.817e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 ST5-213ENST00000526757 3019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.827e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-205ENST00000638289 4614 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.827e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LCLAT1-202ENST00000319406 2774 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.827e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 SPIN3-222ENST00000639482 3719 ntTSL 39.93□□□□□ -0.827e-6■■■■■ 27.5
TBRG4Q969Z0 LCLAT1-209ENST00000478015 1862 ntTSL 29.86□□□□□ -0.837e-6■■■■■ 27.5
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