RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639007.1

SPIN3-218, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 4 BASIC

Gene SPIN3, Length 4,277 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-218ENST00000639007 NISCHQ9Y2I1 1504 aa18.65■□□□□ 0.58
SPIN3-218ENST00000639007 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
SPIN3-218ENST00000639007 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.26■□□□□ 0.35
SPIN3-218ENST00000639007 HRCP23327 699 aa17.18■□□□□ 0.34
SPIN3-218ENST00000639007 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SPIN3-218ENST00000639007 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
SPIN3-218ENST00000639007 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa16.83■□□□□ 0.29
SPIN3-218ENST00000639007 MYT1Q01538 1121 aa16.81■□□□□ 0.28
SPIN3-218ENST00000639007 DCAF8L2P0C7V8 631 aa16.52■□□□□ 0.23
SPIN3-218ENST00000639007 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPIN3-218ENST00000639007 EHMT2Q96KQ7 1210 aa16.43■□□□□ 0.22
SPIN3-218ENST00000639007 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SPIN3-218ENST00000639007 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP16.31■□□□□ 0.2
SPIN3-218ENST00000639007 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
SPIN3-218ENST00000639007 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa16.25■□□□□ 0.19
SPIN3-218ENST00000639007 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.23■□□□□ 0.19
SPIN3-218ENST00000639007 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SPIN3-218ENST00000639007 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.17■□□□□ 0.18
SPIN3-218ENST00000639007 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SPIN3-218ENST00000639007 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
SPIN3-218ENST00000639007 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SPIN3-218ENST00000639007 NEUROD1Q13562 356 aa16.05■□□□□ 0.16
SPIN3-218ENST00000639007 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
SPIN3-218ENST00000639007 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SPIN3-218ENST00000639007 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.87■□□□□ 0.13
SPIN3-218ENST00000639007 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
SPIN3-218ENST00000639007 MYO15BQ96JP2 1530 aa15.78■□□□□ 0.12
SPIN3-218ENST00000639007 BCL11AQ9H165 835 aa15.65■□□□□ 0.1
SPIN3-218ENST00000639007 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SPIN3-218ENST00000639007 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.63■□□□□ 0.09
SPIN3-218ENST00000639007 TRIM41Q8WV44 630 aa15.6■□□□□ 0.09
SPIN3-218ENST00000639007 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa15.51■□□□□ 0.07
SPIN3-218ENST00000639007 BCANQ96GW7 911 aa15.51■□□□□ 0.07
SPIN3-218ENST00000639007 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.4■□□□□ 0.06
SPIN3-218ENST00000639007 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
SPIN3-218ENST00000639007 NEFLP07196 543 aa15.34■□□□□ 0.05
SPIN3-218ENST00000639007 MIER1Q8N108 512 aa15.31■□□□□ 0.04
SPIN3-218ENST00000639007 CSRNP3Q8WYN3 585 aa15.28■□□□□ 0.04
SPIN3-218ENST00000639007 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
SPIN3-218ENST00000639007 ABCC9O60706 1549 aa15.21■□□□□ 0.03
SPIN3-218ENST00000639007 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SPIN3-218ENST00000639007 APLP2Q06481 763 aa15.13■□□□□ 0.01
SPIN3-218ENST00000639007 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
SPIN3-218ENST00000639007 FKBP8Q14318 412 aa15.08■□□□□ 0
SPIN3-218ENST00000639007 UBTFP17480 764 aaKnown RBP15.07■□□□□ 0
SPIN3-218ENST00000639007 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
SPIN3-218ENST00000639007 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa15.06■□□□□ 0
SPIN3-218ENST00000639007 ITGAEP38570 1179 aa15.04■□□□□ -0
SPIN3-218ENST00000639007 NACADO15069 1562 aa14.97□□□□□ -0.01
SPIN3-218ENST00000639007 SCRIBQ14160 1630 aa14.96□□□□□ -0.01
SPIN3-218ENST00000639007 NBR1Q14596 966 aa14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-218ENST00000639007 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SPIN3-218ENST00000639007 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.89□□□□□ -0.03
SPIN3-218ENST00000639007 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SPIN3-218ENST00000639007 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SPIN3-218ENST00000639007 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.85□□□□□ -0.03
SPIN3-218ENST00000639007 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SPIN3-218ENST00000639007 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SPIN3-218ENST00000639007 TRIM52Q96A61 297 aa14.79□□□□□ -0.04
SPIN3-218ENST00000639007 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SPIN3-218ENST00000639007 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.77□□□□□ -0.05
SPIN3-218ENST00000639007 DEKP35659 375 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SPIN3-218ENST00000639007 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
SPIN3-218ENST00000639007 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SPIN3-218ENST00000639007 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
SPIN3-218ENST00000639007 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPIN3-218ENST00000639007 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPIN3-218ENST00000639007 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-218ENST00000639007 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.64□□□□□ -0.07
SPIN3-218ENST00000639007 KCNH8Q96L42 1107 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-218ENST00000639007 ANP32CO43423 234 aa14.59□□□□□ -0.07
SPIN3-218ENST00000639007 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
SPIN3-218ENST00000639007 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SPIN3-218ENST00000639007 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
SPIN3-218ENST00000639007 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
SPIN3-218ENST00000639007 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SPIN3-218ENST00000639007 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SPIN3-218ENST00000639007 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SPIN3-218ENST00000639007 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
SPIN3-218ENST00000639007 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
SPIN3-218ENST00000639007 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
SPIN3-218ENST00000639007 CECR2Q9BXF3 1484 aa14.44□□□□□ -0.1
SPIN3-218ENST00000639007 MSH5O43196 834 aa14.44□□□□□ -0.1
SPIN3-218ENST00000639007 POLR3GLQ9BT43 218 aa14.41□□□□□ -0.1
SPIN3-218ENST00000639007 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa14.39□□□□□ -0.11
SPIN3-218ENST00000639007 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
SPIN3-218ENST00000639007 MROH2BQ7Z745 1585 aa14.37□□□□□ -0.11
SPIN3-218ENST00000639007 IL27Q8NEV9 243 aa14.35□□□□□ -0.11
SPIN3-218ENST00000639007 FAM9BQ8IZU0 186 aa14.32□□□□□ -0.12
SPIN3-218ENST00000639007 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.32□□□□□ -0.12
SPIN3-218ENST00000639007 NEFMP07197 916 aa14.3□□□□□ -0.12
SPIN3-218ENST00000639007 CEP162Q5TB80 1403 aa14.29□□□□□ -0.12
SPIN3-218ENST00000639007 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.29□□□□□ -0.12
SPIN3-218ENST00000639007 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.28□□□□□ -0.12
SPIN3-218ENST00000639007 ARXQ96QS3 562 aa14.27□□□□□ -0.12
SPIN3-218ENST00000639007 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
SPIN3-218ENST00000639007 ERICH6BQ5W0A0 696 aa14.26□□□□□ -0.13
SPIN3-218ENST00000639007 EEA1Q15075 1411 aa14.25□□□□□ -0.13
SPIN3-218ENST00000639007 PPP4R2Q9NY27 417 aa14.24□□□□□ -0.13
SPIN3-218ENST00000639007 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms