Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SPTBN2-204ENST00000529997 8085 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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COPS9Q8WXC6 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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COPS9Q8WXC6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
COPS9Q8WXC6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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