Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KCNMB4Q86W47 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms