Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPOCD1Q6ZMY3 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPOCD1Q6ZMY3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms