Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RBL2-202ENST00000379935 4467 ntTSL 1 (best)5.47□□□□□ -1.536e-7■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 INO80-211ENST00000616814 4272 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.825e-7■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 INO80-205ENST00000558357 5503 ntTSL 1 (best)8.95□□□□□ -0.985e-7■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 GEMIN2-203ENST00000396249 801 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 GEMIN2-202ENST00000308317 1420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.012e-6■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 RALGAPA1-215ENST00000556839 1305 ntTSL 32.72□□□□□ -1.971e-10■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 EFTUD2-221ENST00000591856 366 ntTSL 36.98□□□□□ -1.296e-8■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 29.5
PRPF8Q6P2Q9 COG2-204ENST00000473671 436 ntTSL 211.99□□□□□ -0.491e-7■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 RNF4-208ENST00000507247 616 ntTSL 1 (best)11.63□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 29.5
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PRPF8Q6P2Q9 RNF4-218ENST00000513284 517 ntTSL 410.16□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 29.5
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