Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
REEP3Q6NUK4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms