Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VIRMAQ69YN4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms