Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
OTUD1Q5VV17 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
OTUD1Q5VV17 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms