Protein–RNA interactions for Protein: Q58WW2

DCAF6, DDB1- and CUL4-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF6Q58WW2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCAF6Q58WW2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms