Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TDRD12Q587J7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms