Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL22Q53GT1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL22Q53GT1 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms