Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC38Q502W7 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms