Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAY7

SMU1, WD40 repeat-containing protein SMU1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMU1Q2TAY7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SMU1Q2TAY7 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms