Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UPP1Q16831 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms