Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATP6AP1Q15904 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATP6AP1Q15904 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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