Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRIP13Q15645 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRIP13Q15645 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms