Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB39AQ14964 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms