Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPARCL1Q14515 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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